Definition peptidbindning

Termen länk har flera användningsområden: i detta fall är vi intresserade av att hänvisa till dess mening som en fackförening eller en länk mellan olika element. Peptid är å andra sidan relaterat till peptider : de molekyler som bildas av en kovalent union av aminosyror (organiska substanser vars molekylära sammansättning har en karboxylgrupp och en aminogrupp).

Peptidbindning

Det kallas peptidbindning till den kemiska bindningen som är etablerad mellan karboxylgruppen i en aminosyra och aminogruppen i en annan aminosyra . Denna typ av länk, där en vattenmolekyl förloras, möjliggör bildandet av de ovan nämnda peptiderna och proteinerna .

Vid bindning av en aminogrupp ( -NH2 ) och en karboxylgrupp ( -COOH ) med förlust av en vattenmolekyl etableras en CO-NH- bindning. Utvecklingen av denna länk behöver alltid energins bidrag; I sin tur, när peptidbindningen bryts, inträffar energifrisättning.

Brytningen av en peptidbindning kan ske genom hydrolys : detta kallas splittringen som en molekyl registrerar genom vatten. Hydrolys, i den naturliga miljön, sker mycket långsamt, även om det är möjligt att påskynda processen med olika tekniker .

I närvaro av vatten kan en peptidbindning brytas med en mängd fri energi som är omkring 8-16 kilojoules / mol (vilket motsvarar 2-4 kcal / mol). Kilojouleenheten per mol, som kan symboliseras som kJ / mol, kännetecknas av det internationella systemet av enheter ( SI ) och motsvarar förhållandet mellan energi och mängden materia : energi uttrycks i kilojoule och mäten mäts i mol

Kilojouleerna är inte mer än tusen joules, en annan måttenhet som kännetecknas av det internationella systemet, vars ursprungliga namn är Joule och används för mätning av värme, arbete och energi. I tekniska termer är dess definition "mängden arbete som utförs av en newton med en konstant kraft längs en mätare i riktning mot kraften". Molenheten å andra sidan används för att mäta mängden av ett givet ämne och är en del av SI: s grundläggande fysiska storheter .

För att påskynda hydrolysen av en peptidbindning, som i naturen kan ta mer än ett årtusende, kan forskare välja en av följande metoder :

* sur hydrolys : det uppnås genom att låta proteinet koka under lång tid med starka syratypslösningar (H2SO4 och HCI). Denna väg uppnår fullständig förstöring av tryptofan och en del av treonin och serin;

Peptidbindning * basisk hydrolys : det utförs vanligtvis med användning av BaOH eller NaOH, och förstör inte de aminosyror som nämns i föregående metod;

* enzymatisk hydrolys : i levande varelser är detta sätt att försämra peptidbindningarna den vanligaste. I detta fall uppträder proteolytiska enzymer som uppträder långsamt och ofta inte fullbordar sitt arbete, men inte heller förstörelsen av aminosyror eller racemisering (när en optiskt aktiv förening blir racemisk) inträffar. Denna typ av hydrolys är mycket specifik;

* Hydrolys efter temperatur : Om förhållandena är normala, förstörs peptidbindningarna, men proteinet kan denatureras (det vill säga dess sekundära, tertiära och kvartära strukturer bryts). Å andra sidan, om en temperatur högre än 110 ° appliceras i 48 timmar, är det möjligt att förstöra länkarna.

Det bör noteras att i allmänhet representeras peptidbindningen som ett enkelbindning . Det har i alla fall flera funktioner som gör det nära en dubbel länk. Därför nämner specialister vanligtvis att ett peptidbindning har egenskaper som placerar det halvvägs mellan en enda länk och en dubbel länk.

Rekommenderas