Tanken om fylogeni används i biologins sammanhang för att hänvisa till artens ursprung och utveckling . Konceptet kan också referera till grenen av denna vetenskap som fokuserar på släktskapsförbindelserna som finns mellan de olika uppsättningarna av levande varelser.

Från evolutionsteorin drivs av den engelska forskaren Charles Darwin blev det nödvändigt att känna till varje arts evolutionära historia. Fylogenien framkom med syftet att studera evolutionära relationer, analysera hur karaktärerna i de olika taxorna distribueras.

Dessa data möjliggör skapandet av fylogenetiska träd, som beskriver de evolutionära relationerna mellan de arter som har en förfader gemensamt. Fylogenetiska träd tillåter i sin tur att utveckla den fylogenetiska klassificeringen som fastställer den evolutionära närheten mellan arter.

För att kunna veta en organisms fylogeni måste man studera sitt DNA, dess anatomi och dess morfologi bland många andra egenskaper. Resultaten av denna typ av studie gör det möjligt för oss att känna till likheterna och skillnaderna mellan arten och därmed etablera deras evolutionära relationer.

En klade är en grupp bestående av en förfader och alla hans efterkommande. Också kallad monofyletisk grupp, består av den gemensamma förfader (ett rike, en art eller en befolkning) och alla organismer som nedstammar från den. Om denna grupp är utesluten från en efterkommer kallas den en parafyletisk grupp . Under tiden är grupper som består av arter som faller från mer än en förfader kallad polyphyletiska .